Paket: gromacs-mpi (2021.4-2) [debports]

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Homepage [www.gromacs.org]

Molecular dynamics sim, binaries for MPI parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the default MPI interface on the chosen architecture. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs-mpi

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.32)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (doppelte Genauigkeit)
dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

Bibliothek zur Berechnung Schneller Fourier-Transformationen (einfache Genauigkeit)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhwloc15 (>= 2.6.0)

Hierarchische Ansicht des Rechners - Laufzeitbibliotheken
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1)

Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: mpi-default-bin

Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)
dep: sse4.2-support [x32]

CPU feature checking - require SSE4.2
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

rec: gromacs

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

sug: gromacs-data

Daten und Dokumentation für GROMACS, einen Simulator für Moleküldynamik

gromacs-mpi herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
hppa (inoffizielle Portierung)	4.369,0 kB	13.129,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	3.356,8 kB	13.779,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	4.881,0 kB	12.147,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	6.886,7 kB	18.287,0 kB	[Liste der Dateien]