[ ソース: cyvcf2 ]
パッケージ: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 など)
python3-cyvcf2 に関するリンク
Debian の資源:
cyvcf2 ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Steffen Moeller (QA ページ)
- Liubov Chuprikova (QA ページ)
- Étienne Mollier (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
その他の python3-cyvcf2 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386, s390x]
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
- dep: python3 (<< 3.14)
- dep: python3 (>= 3.13~)
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- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
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- dep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
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- dep: python3-numpy2-abi0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
- または python3-numpy-abi9
- パッケージは利用できません
python3-cyvcf2 のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.31.1-2+b3 | 886.6 kB | 5,624.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 0.31.1-2+b3 | 849.1 kB | 5,559.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 0.31.1-2+b3 | 852.8 kB | 5,357.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 0.31.1-2+b4 | 881.9 kB | 5,645.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 0.31.1-2+b3 | 874.6 kB | 5,751.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 0.31.1-2+b3 | 883.3 kB | 5,403.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 0.31.1-2+b3 | 864.6 kB | 5,594.0 kB | [ファイル一覧] |