Paquet : python3-cyvcf2 (0.31.1-2 et autres)

Liens pour python3-cyvcf2

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Paquets similaires :

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386, s390x]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.14)

dep: python3 (>= 3.13~)
dep: python3-click

kit de création d’interface en ligne de commande – Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3
dep: python3-numpy

bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3
dep: python3-numpy2-abi0

paquet virtuel fourni par python3-numpy

ou python3-numpy-abi9

Paquet indisponible

Télécharger python3-cyvcf2

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 ko	5 624,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 ko	5 559,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 ko	5 357,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 ko	5 645,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 ko	5 751,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 ko	5 403,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 ko	5 594,0 ko	[liste des fichiers]