[ ソース: ataqv ]
パッケージ: ataqv (1.3.0+ds-2)
ATAC-seq QC and visualization
A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.
その他の ataqv 関連パッケージ
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- dep: fonts-font-awesome
- iconic font designed for use with Twitter Bootstrap
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- dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)
- 時間、時刻、クロックの C++ 表現
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libjs-jquery
- JavaScript library for dynamic web applications
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- dep: libjs-jquery-datatables
- jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources
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- dep: libjs-jquery-datatables-extensions
- extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources
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- dep: libncurses6 (>= 6)
- 端末処理用共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [armel 以外]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-3) [armel]
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- dep: node-d3
- Data-Driven Documents to visualize data
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- dep: node-normalize.css
- Modern alternative to CSS resets
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- sug: macs
- Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers
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- sug: picard-tools
- Command line tools to manipulate SAM and BAM files
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- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- sug: wget
- ウェブからファイルを取得
ataqv のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 3,321.9 kB | 6,513.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 3,266.8 kB | 6,464.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 3,239.7 kB | 6,270.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 3,253.4 kB | 5,886.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 3,360.7 kB | 6,658.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 3,263.9 kB | 6,997.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 3,275.8 kB | 6,980.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 3,311.6 kB | 6,849.0 kB | [ファイル一覧] |