[ ソース: samtools ]
パッケージ: samtools (1.16.1-1)
samtools に関するリンク
Debian の資源:
samtools ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Charles Plessy (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Étienne Mollier (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [www.htslib.org]
類似のパッケージ:
processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.
その他の samtools 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libhts3 (>= 1.16)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libncurses6 (>= 6)
- 端末処理用共有ライブラリ
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- dep: libtinfo6 (>= 6)
- 端末を扱う低レベルの terminfo 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, i386, mipsel]
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- sug: cwltool
- Common Workflow Language reference implementation
samtools のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 592.4 kB | 1,304.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 566.4 kB | 1,580.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 558.8 kB | 1,573.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 561.4 kB | 1,445.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 622.1 kB | 1,417.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 572.9 kB | 1,729.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 581.2 kB | 1,659.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 614.7 kB | 1,836.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 566.6 kB | 1,332.0 kB | [ファイル一覧] |