[ Source: parallel-fastq-dump ]
Package: parallel-fastq-dump (0.6.7-3)
Links for parallel-fastq-dump
Debian Resources:
Download Source Package parallel-fastq-dump:
- [parallel-fastq-dump_0.6.7-3.dsc]
- [parallel-fastq-dump_0.6.7.orig.tar.gz]
- [parallel-fastq-dump_0.6.7-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
wrapper parallelo di fastq-dump
fastq-dump di NCBI può essere a volte molto lento, anche se si hanno le risorse (rete, IO, CPU) per andare più veloci, anche se si è già scaricato il file sra. Questo strumento velocizza il processo dividendo il lavoro in thread multipli.
Ciò è possibile perché fastq-dump ha opzioni (-N e -X) per interrogare intervalli specifici del file sra; questo strumento funziona dividendo il lavoro nel numero richiesto di thread, eseguendo più fastq-dump in parallelo e concatenando i risultati insieme, come se si fosse semplicemente eseguita una normale chiamata a fastq-dump.
Other Packages Related to parallel-fastq-dump
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
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- dep: sra-toolkit
- utilità per Sequence Read Archive di NCBI
Download parallel-fastq-dump
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 5.5 kB | 24.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 5.5 kB | 24.0 kB | [list of files] |