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Package: trinityrnaseq-examples (2.15.1+dfsg-5 and others)

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file comuni di esempio e di test per assemblati de novo di RNA-Seq

Trinity rappresenta un metodo innovativo per una ricostruzione de novo efficiente e robusta di trascrittomi da dati di RNA-seq. Trinity combina tre moduli software indipendenti: Inchworm, Chrysalis e Butterfly, applicati sequenzialmente per elaborare grandi volumi di letture di RNA-seq. Trinity partiziona i dati delle sequenze in molti grafi de Bruijn individuali, ciascuno dei quali rappresenta la complessità trascrizionale ad un dato gene o locus, e poi elabora ciascun grafo indipendentemente per estrarre isoforme di splicing a lunghezza intera e per separare i trascritti derivati da geni paraloghi.

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riscv64 2.15.1+dfsg-5+b1 292,823.7 kB449,932.0 kB [list of files]