Package: snippy-examples (4.6.0+dfsg-4)

identificazione rapida di varianti aploidi e allineamento di genoma core (esempi)

Snippy trova gli SNP tra un genoma di riferimento aploide e le letture di sequenziamento NGS dell'utente. Trova sia le sostituzioni (snps) sia le inserzioni/delezioni (indels). Usa tante CPU quante gliene vengono fornite in un unico computer (testato con 64 core). È progettato pensando alla velocità e produce un insieme coerente di file di output in un'unica cartella. Può poi prendere un insieme di risultati di Snippy che usano lo stesso riferimento e generare un allineamento di SNP core (e da ultimo un albero filogenomico).

Questo pacchetto contiene dati d'esempio per testare snippy.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):