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lettura, scrittura e analisi di traiettorie di MD in Python (documentazione)

Lettura, scrittura e analisi di traiettorie di MD con solo poche righe di codice Python.

MDTraj è una libreria Python che permette di manipolare traiettorie di dinamica molecolare (MD). Le sue funzionalità includono:

 * ampio supporto per formati di MD, inclusi pdb, xtc, trr, dcd, binpos,
   netcdf, mdcrd, prmtop e altri;
 * calcoli RMSD estremamente veloci (4 volte la velocità dell'originale
   Theobald QCP).
 * funzioni esaustive di analisi, incluse quelle che calcolano legami,
   angoli, diedri, legami idrogeno, struttura secondario e ciò che è
   osservabile con NMR;
 * API leggera e pythonica.

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