Package: r-bioc-pfamanalyzer (1.2.0+dfsg-1)

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identificazione di isotipi di dominio in dati Pfam per GNU R

I domini delle proteine sono una delle più importanti annotazioni delle proteine, con lo strumento/database pfam che è (di gran lunga) lo strumento più utilizzato. Questo pacchetto per R permette all'utente di leggere in R le predizioni di Pfam sia dal server Web sia da esecuzioni autonome. È stato recentemente dimostrato che la maggior parte dei domini delle proteine umane esiste come varianti multiple distinte denominate isotipi di dominio. Diversi isotipi di dominio vengono usati in maniera specifica per cellula, tessuto e malattia. Di conseguenza, è stato visto come gli isotipi di dominio, confrontati l'uno con l'altro, modulano o sopprimono la funzionalità di un dominio di proteina. Questo pacchetto R permette l'identificazione e la classificazione di tali isotipi di dominio da dati Pfam.

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