Package: probalign (1.4-10 and others)
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- Homepage [web.njit.edu]
Similar packages:
allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione
Probalign usa stime della probabilità a posteriori della funzione di ripartizione per calcolare allineamenti di sequenze multiple con la massima accuratezza attesa. Funziona in modo migliore rispetto ai programmi di allineamento più usati Probcons v1.1, MAFFT v5.851 e MUSCLE v3.6 nei test di prestazione BAliBASE 3.0, HOMSTRAD e OXBENCH, e tale miglioramento è statisticamente significativo. I miglioramenti di Probalign sono maggiori negli insiemi di dati che contengono estensioni terminali N/C e in quelli con sequenze di lunghezze elevate ed eterogenee. Negli insiemi di dati con lunghezze eterogenee contenenti ripetizioni, l'accuratezza degli allineamenti di Probalign è del 10% e il 15% maggiore rispetto agli altri tre metodi, quando la deviazione standard della lunghezza è almeno 300 e 400.
Other Packages Related to probalign
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- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [not riscv64]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
Download probalign
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1.4-10 | 69.0 kB | 220.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1.4-10 | 68.9 kB | 175.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.4-10 | 64.6 kB | 219.0 kB | [list of files] |
| armel | 1.4-10 | 55.1 kB | 142.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1.4-10 | 53.9 kB | 114.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 1.4-10 | 66.9 kB | 156.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1.4-10 | 61.4 kB | 158.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1.4-10 | 97.8 kB | 292.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1.4-10 | 60.2 kB | 162.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1.4-10 | 65.4 kB | 223.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1.4-10 | 70.0 kB | 219.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.4-10 | 78.4 kB | 219.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.4-10+b1 | 67.4 kB | 132.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.4-10 | 56.7 kB | 171.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1.4-10 | 72.5 kB | 155.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1.4-10 | 60.5 kB | 1,054.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1.4-10 | 70.0 kB | 170.0 kB | [list of files] |