[ Source: prime-phylo ]
Package: prime-phylo (1.0.11-11)
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Similar packages:
stima bayesiana di alberi genetici che tiene in considerazione l'albero delle specie
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) è un pacchetto che permette l'inferenza di parametri evoluzionistici in un'infrastruttura bayesiana usando simulazioni con catene di Markov Monte Carlo. Una caratteristica distintiva di PrIME è che l'albero delle specie viene tenuto in considerazione quando vengono analizzati gli alberi genetici.
I dati di input di PrIME è un allineamento di sequenze multiple in formato FASTA e i dati di output contengono alberi in formato Newick.
Other Packages Related to prime-phylo
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- dep: libblas3
- implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)
- interfaccia C++ per MPI (Message Passing Interface)
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- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- libreria di serializzazione per C++
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: liblapack3
- libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- libreria XML di GNOME
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
-
- sug: mafft
- programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
-
- sug: mrbayes
- inferenza bayesiana per filogenetica
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- sug: muscle
- programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche
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- sug: njplot
- programma per disegnare alberi filogenetici
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- sug: phyml
- stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza
-
- sug: probalign
- allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione
-
- sug: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
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- sug: raxml
- RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) di alberi filogenetici
-
- sug: treeviewx
- visualizza e stampa alberi filogenetici
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| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 820.6 kB | 3,891.0 kB | [list of files] |