Package: meryl (0~20150903+r2013-8 and others)

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Homepage [kmer.sourceforge.net]

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conteggio di k-meri in- e out-of-core e utilità

meryl calcola il contenuto di k-meri di sequenze genomiche. Il contenuto di k-meri è rappresentato come una lista di k-meri e il numero di volte che ognuno di essi appare nelle sequenze di input. Il k-mero può essere ristretto solamente al k-mero forward, solo a quello reverse o al k-mero canonico (lessicograficamente più piccolo del k-mero forward e reverse ad ogni posizione). Meryl può riportare l'istogramma dei conteggi, la lista dei k-meri e il loro conteggio o può effettuare operazioni matematiche o insiemistiche sui file dei dati elaborati.

Questo pacchetto fa parte della suite Kmer.

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dep: libc6 (>= 2.34)

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

libreria di supporto a GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

libreria GNU Standard C++, versione 3

sug: gridengine-client

utilità per la gestione di code di Grid Engine

Download meryl

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	0~20150903+r2013-8+b3	208.3 kB	1,829.0 kB	[list of files]