Package: perm (0.4.0-8 and others)
mappatura efficiente di letture brevi con semi spaziati periodicamente
PerM è un pacchetto software che è stato progettato per eseguire allineamenti a livello di genoma estremamente efficienti per centinaia di milioni di letture brevi prodotte da piattaforme di sequenziamento ABI SOLiD e Illumina. Attualmente PerM è in grado di fornire sensibilità totale per allineamenti con fino a 4 non corrispondenze per letture SOLiD di 50 pb e 9 non corrispondenze per letture Illumina di 100 pb.
Other Packages Related to perm
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- dep: libbsd0 (>= 0.0)
- funzioni di utilità da sistemi BSD - libreria condivisa
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- dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]
- dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [not arm64, armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64el, s390x]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not arm64, riscv64]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
Download perm
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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alpha (unofficial port) | 0.4.0-8 | 128.2 kB | 413.0 kB | [list of files] |
amd64 | 0.4.0-8+b1 | 124.4 kB | 337.0 kB | [list of files] |
arm64 | 0.4.0-8+b2 | 114.6 kB | 348.0 kB | [list of files] |
armel | 0.4.0-8+b1 | 108.0 kB | 348.0 kB | [list of files] |
armhf | 0.4.0-8+b1 | 111.8 kB | 284.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 0.4.0-8 | 131.4 kB | 358.0 kB | [list of files] |
i386 | 0.4.0-8+b1 | 141.8 kB | 392.0 kB | [list of files] |
ia64 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 153.2 kB | 652.0 kB | [list of files] |
loong64 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 122.2 kB | 348.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 0.4.0-8 | 130.6 kB | 371.0 kB | [list of files] |
mips64el | 0.4.0-8+b1 | 127.2 kB | 502.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 129.6 kB | 476.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 0.4.0-8+b1 | 132.1 kB | 477.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 0.4.0-8+b1 | 133.5 kB | 292.0 kB | [list of files] |
s390x | 0.4.0-8+b1 | 113.2 kB | 345.0 kB | [list of files] |
sh4 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 148.8 kB | 344.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 108.2 kB | 343.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 0.4.0-8 | 125.4 kB | 331.0 kB | [list of files] |