Package: libvcflib1 (1.0.9+dfsg-1 and others) [debports]

Links for libvcflib1

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

libreria C++ per analizzare e manipolare file VCF

Variant Call Format (VCF) è un formato testuale semplice delimitato da tabulazioni pensato per descrivere in modo conciso variazioni tra individui indicizzate rispetto ad un riferimento. VCF fornisce un formato comune di interscambio per la descrizione di variazioni in individui e popolazioni di campioni, ed è diventato il formato standard di fatto per i rapporti per una vasta gamma di rilevatori di varianti genomiche.

vcflib fornisce metodi per manipolare ed interpretare variazioni di sequenza come possono essere descritte da VCF. È:

 * un'API per analizzare e lavorare su record di variazioni genomiche
   come possono essere descritte dal formato VCF;
 * una raccolta di utilità a riga di comando per eseguire manipolazioni
   complesse di file VCF.

Other Packages Related to libvcflib1

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [not ia64, riscv64, sh4]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.33) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [ia64, sparc64]

libreria per indicizzare ed estrarre sequenze da file FASTA (libreria)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [not ia64, sparc64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64, x32]

libreria di supporto a GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

libreria di supporto a GCC
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determina regioni simili tra due stringhe o sequenze genomiche (libreria)
dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11)

libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
dep: libwfa2-0 (>= 2.3.2) [riscv64]

exact gap-affine algorithm (shared library)

Download libvcflib1

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	181.3 kB	833.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	137.1 kB	405.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	153.0 kB	533.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	1.0.9+dfsg-1	167.7 kB	377.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	167.4 kB	406.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	123.4 kB	1,057.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	149.7 kB	397.0 kB	[list of files]