Package: hinge (0.5.0-7 and others)
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Similar packages:
assemblatore di letture lunghe del genoma basato su hinging
HINGE è un assemblatore di genoma che cerca di ottenere una risoluzione ottimale delle ripetizioni distinguendo le ripetizioni che possono essere risolte sulla base dei dati, da quelle che non possono esserlo. Ciò è ottenuto aggiungendo "cerniere" alle letture per costruire un grafo di sovrapposizioni nel quale solo le ripetizioni irrisolvibili sono fuse. Come risultato, HINGE combina la resilienza agli errori degli assemblatori basati sulle sovrapposizioni con le capacità di risoluzione delle ripetizioni degli assemblatori di grafi de Bruijn.
Other Packages Related to hinge
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- dep: daligner
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- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.27) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, hppa, loong64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [ppc64, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [not alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]
- fast type-safe C++ formatting library -- library
-
- dep: libfmt9 (>= 9.1.0+ds1) [alpha]
- fast type-safe C++ formatting library -- library
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64el, x32]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [ppc64]
- Package not available
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]
-
- dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Package not available
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- dep: libgomp1 (>= 4.2.1)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not hppa, ppc64, sparc64, x32]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, ppc64, sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [x32]
-
- dep: python [hppa, ppc64, sparc64]
- Package not available
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- dep: python-colormap [hppa, ppc64, sparc64]
- Package not available
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- dep: python-configparser [hppa, ppc64, sparc64]
- Package not available
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- dep: python-matplotlib [hppa, ppc64, sparc64]
- Package not available
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- dep: python-networkx [hppa, ppc64, sparc64]
- Package not available
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- Package not available
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- Package not available
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- libreria di compressione - runtime
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k]
Download hinge
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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alpha (unofficial port) | 0.5.0-7 | 478.9 kB | 3,840.0 kB | [list of files] |
amd64 | 0.5.0-7+b3 | 466.2 kB | 3,096.0 kB | [list of files] |
arm64 | 0.5.0-7+b4 | 419.8 kB | 3,060.0 kB | [list of files] |
armel | 0.5.0-7+b2 | 399.4 kB | 2,775.0 kB | [list of files] |
armhf | 0.5.0-7+b3 | 405.5 kB | 2,351.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 0.5.0-2 | 366.1 kB | 2,439.0 kB | [list of files] |
i386 | 0.5.0-7+b3 | 459.8 kB | 3,215.0 kB | [list of files] |
loong64 (unofficial port) | 0.5.0-7+b1 | 432.5 kB | 3,124.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 0.5.0-7+b2 | 409.4 kB | 2,911.0 kB | [list of files] |
mips64el | 0.5.0-7+b2 | 395.8 kB | 3,429.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 0.5.0-2 | 367.3 kB | 3,140.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 0.5.0-7+b3 | 448.7 kB | 3,572.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 0.5.0-7+b3 | 457.6 kB | 2,516.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 0.5.0-2 | 328.1 kB | 2,445.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 0.5.0-6 | 530.1 kB | 3,850.0 kB | [list of files] |