Package: belvu (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

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visualizzatore di allineamenti multipli di sequenze e strumento filogenetico

Belvu è un visualizzatore di allineamenti multipli di sequenze e strumento filogenetico con un esteso insieme di modalità configurabili dall'utente per colorare i residui.

 * Visualizza allineamenti multipli di sequenze.
 * I residui possono essere colorati per conservazione, con soglia e
   colori configurabili dall'utente.
 * I residui possono essere colorati per tipo di residuo (configurabile
   dall'utente.
 * Gli schemi dei colori possono essere importati o esportati.
 * Le voci Swissprot (o PIR) possono essere recuperate tramite doppio
   clic.
 * La posizione nell'allineamento può essere facilmente tracciata.
 * Eliminazione manuale di righe e colonne.
 * Modifica automatica di righe e colonne sulla base di criteri
   personalizzabili:
    - rimozione di colonne con soli gap;
    - rimozione di tutti i gap;
    - rimozione di sequenze ridondanti;
    - rimozione di una colonna in base a una percentuale di gap
      specificata dall'utente;
    - filtraggio di sequenze in base a una percentuale di identicità;
    - rimozione di sequenze in base a una percentuale di gap
      specificata dall'utente;
    - rimozione di sequenze parziali (quelle che iniziano o finiscono
      con gap);
    - rimozione di colonne per conservazione (con soglia superiore e
      inferiore specificate dall'utente).
 * L'allineamento può essere salvato nei formati Stockholm, Selex, MSF o
   FASTA.
 * Le matrici di distanza tra sequenze possono essere generate usando
   svariate metriche di distanza.
 * Le matrici di distanza possono essere importate o esportate.
 * Gli alberi filogenetici possono essere costruiti sulla base di
   svariati algoritmi di ricostruzione dell'albero basati sulla distanza.
 * Gli alberi possono essere salvati nel formato New Hampshire.
 * Belvu può eseguire la ricostruzione filogenetica bootstrap.

Tags: Interface Toolkit: GTK

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libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione OpenSSL)
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libreria per interfacce utente grafiche GTK - vecchia versione
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impaginazione e rendering di testo internazionalizzato
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

libreria GNU Standard C++, versione 3

Download belvu

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,029.2 kB	1,278.0 kB	[list of files]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,030.3 kB	1,235.0 kB	[list of files]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,020.6 kB	1,275.0 kB	[list of files]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,014.3 kB	1,210.0 kB	[list of files]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,014.2 kB	1,146.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,025.9 kB	1,218.0 kB	[list of files]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,039.3 kB	1,262.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,051.1 kB	1,457.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,026.2 kB	1,275.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,027.8 kB	1,242.0 kB	[list of files]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,035.6 kB	1,360.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,037.8 kB	1,339.0 kB	[list of files]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,037.4 kB	1,339.0 kB	[list of files]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,027.1 kB	1,191.0 kB	[list of files]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,025.7 kB	1,247.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,042.1 kB	1,275.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,014.0 kB	1,991.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,030.2 kB	1,214.0 kB	[list of files]