Package: clonalframe (1.2-11 and others)
Links for clonalframe
Debian Resources:
Download Source Package clonalframe:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.xavierdidelot.xtreemhost.com]
Similar packages:
inferenza della microevoluzione batterica usando dati di sequenze multi-loci
ClonalFrame identifica le relazioni clonali tra i membri di un campione, stimando al contempo la posizione nei cromosomi di eventi di ricombinazione omologa che hanno perturbato l'eredità clonale.
ClonalFrame può essere applicato a qualsiasi tipo di dati di sequenza, da un singolo frammento di DNA a genomi interi. È ben adatto per l'analisi di dati MLST, in cui sono stati sequenziati 7 frammenti genetici, ma diventa progressivamente più potente mano a mano che le regioni sequenziate aumentano di lunghezza fino a diventare interi genomi. Tuttavia, richiede che le sequenze siano allineate. Se si hanno dati genomici non allineati, è raccomandato l'uso di Mauve che produce allineamenti di interi genomi batterici nell'esatto formato richiesto per le analisi con ClonalFrame.
Other Packages Related to clonalframe
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- sug: clonalframeml
- efficiente inferenza di ricombinazione in genomi interi di batteri
Download clonalframe
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| armel | 1.2-11+b2 | 43.5 kB | 151.0 kB | [list of files] |