Package: bali-phy (4.0~beta13+dfsg-1) [debports]

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inferenza baiesiana di allineamenti e filogenie

BAli-Phy (Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny) stima allineamenti multipli di sequenze e alberi evolutivi da sequenze di codoni, amminoacidi o DNA non allineato. BAli-Phy usa MCMC per stimare alberi evolutivi, selezione positiva e lunghezze dei rami mentre fa la media su allineamenti alternativi. BAli-Phy può visualizzare graficamente l'ambiguità degli allineamenti in un diagramma AU (alignment uncertainty).

BAli-Phy può anche stimare filogenie da un allineamento fisso (come MrBayes e BEAST) usando modelli di sostituzione come GTR+gamma. BAli-Phy stima automaticamente tassi relativi per ciascun gene.

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sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

sug: figtree

visualizzatore grafico di alberi filogenetici
sug: seaview

interfaccia multipiattaforma per l'allineamento di sequenze e filogenia

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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