Package: cd-hit (4.6.8-2)

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Maintainers:

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External Resources:

Homepage [weizhong-lab.ucsd.edu]

Similar packages:

suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze

cd-hit contiene svariati programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze. cd-hit raggruppa in cluster le proteine che soddisfano una soglia di similarità definita dall'utente. cd-hit-est è simile a cd-hit, ma progettato per raggruppare sequenze di nucleotidi (senza introni). cd-hit-est-2d è simile a cd-hit-2d, ma progettato per confrontare due insiemi di dati di nucleotidi. In questo pacchetto sono contenuti anche diversi altri programmi correlati. Per maggiori informazione vedere il manuale utente di cd-hit, anch'esso parte di questo pacchetto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

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libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

libreria GNU Standard C++, versione 3
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"Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

Download cd-hit

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	508.9 kB	1,377.0 kB	[list of files]
arm64	492.7 kB	1,280.0 kB	[list of files]
armhf	484.1 kB	1,083.0 kB	[list of files]
i386	508.3 kB	1,424.0 kB	[list of files]