Package: python3-pyvcf (0.6.8+git20170215.476169c-1)

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analizzatore di Variant Call Format (VCF) per Python 3

Variant Call Format (VCF) specifica il formato di un file di testo usato in bioinformatica per memorizzare variazioni di sequenze di geni. Il formato è stato sviluppato con l'avvento di progetti di sequenziamento di DNA e di genotipizzazione su larga scala, come il 1000 Genomes Project.

L'intento di questo modulo è di imitare il modulo "csv" nella stdlib di Python, in contrasto con formati più flessibili di serializzazione come JSON o YAML. "vcf" tenterà di analizzare il contenuto di ogni record sulla base dei tipi di dato specificati nelle righe di meta-informazioni, e precisamente le righe ##INFO e ##FORMAT. Se tali righe sono mancanti o incomplete, controllerà i tipi riservati menzionati nelle specifiche. In mancanza di ciò, restituirà semplicemente delle stringhe.

Questo pacchetto fornisce i moduli per Python 3.

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