Package: canu (1.8+dfsg-2)

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Homepage [canu.readthedocs.org]

Similar packages:

assemblatore di sequenze di molecole singole per genomi

Canu è un fork di Celera Assembler, progettato per sequenziamento con alto rumore di molecole singole (come PacBio RS II o Oxford Nanopore MinION).

Canu è una catena pipe di assemblaggio gerarchico che viene eseguita in quattro passi:

 * rilevamento di sovrapposizioni in sequenze con alto rumore usando MHAP;
 * generazione del consenso delle sequenze corrette;
 * taglio delle sequenze corrette;
 * assemblaggio delle sequenze corrette dopo il taglio.

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libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: mhap (>= 2.1.3)

hash con sensibilità locale per rilevare sovrapposizioni di letture lunghe
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"Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

sug: nanopolish

identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori
sug: pbgenomicconsensus

strumento di Pacific Biosciences per identificare varianti e consenso

Download canu

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,971.5 kB	12,736.0 kB	[list of files]