Package: dialign-tx (1.0.2-13)

allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

DIALIGN-TX è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze proteiche o di DNA. È una completa reimplementazione dell'approccio basato su segmenti che include diverse nuove migliorie e modelli euristici che migliorano significativamente la qualità degli allineamenti in output rispetto a DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Per l'allineamento di coppie, DIALIGN-TX usa un algoritmo di concatenazione dei frammenti che favorisce catene di allineamenti locali a basso punteggio rispetto a frammenti isolati ad alto punteggio. Per gli allineamenti multipli, DIALIGN-TX usa una procedura migliorata che è meno sensibile a somiglianze spurie tra sequenze locali.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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