[ Source: nanopolish ]
Package: nanopolish (0.13.2-3)
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Similar packages:
identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori
Nanopolish usa un modello di Markov nascosto segnale-livello per l'identificazione di sequenze di consenso di dati di sequenziamento a nanopori di genomi. Può eseguire l'analisi a livello di segnale di dati di sequenziamento Oxford Nanopore. Nanopolish può calcolare una sequenza di consenso migliorata per una bozza di assemblaggio genomico, rilevare modificazioni di basi, identificare SNP e indel in rapporto ad un genoma di riferimento e altro ancora.
Other Packages Related to nanopolish
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libhdf5-103-1
- file runtime C di HDF5 - versione seriale
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
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- rec: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
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- rec: python3-pysam
- interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)
Download nanopolish
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armhf | 2,141.1 kB | 8,985.0 kB | [list of files] |