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Package: phipack (0.0.20160614-5)

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test PHI e altri test di ricombinazione

Il pacchetto software PhiPack implementa diversi test di ricombinazione e può anche produrre matrici di incompatibilità raffinate. Specificamente, PHIPack implementa il "Pairwise Homoplasy Index", il "Maximum Chi2" e il "Neighbour Similarity Score". Il programma Phi può essere eseguito per produrre un p-value di ricombinazione all'interno di un insieme di dati e il programma profile può essere eseguito per determinare le regioni che mostrano le prove più forti di mosaicismo.

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