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Package: nanolyse (1.2.0-1)

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rimuove le letture del fago lambda da un file fastq

NanoLyse è uno strumento per la rimozione rapida di DNA contaminante, che usa l'allineatore Minimap2 attraverso il collegamento Python mappy. Un'applicazione tipica è la rimozione del frammento di DNA di controllo del fago lambda fornito da ONT, per il quale è inclusa in questo pacchetto la sequenza di riferimento. Questo approccio, tuttavia, può portare a perdite non volute di letture da regioni altamente omologhe al genoma del fago lambda.

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