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inferenza degli allineamenti strutturali secondari dell'RNA - documentazione

Infernal ("INFERence of RNA ALignment", "inferenza per l'allineamento dell'RNA") cerca in un database di sequenze DNA somiglianze tra strutture e sequenze di RNA. Fornisce un'implementazione di un caso speciale delle grammatiche senza contesto con profilo stocastico chiamate modelli covarianti (CM). Un CM è come un profilo di sequenza, ma dà una valutazione combinando il consenso della sequenza e il consenso sulla struttura secondaria dell'RNA, così in molti casi è più efficace nell'identificare omologhi RNA che conservano la loro struttura secondaria più che la loro sequenza primaria.

Questo pacchetto fornisce la documentazione che viene distribuita con il codice di infernal.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Made Of: made-of::pdf, role::documentation

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