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Package: dialign-tx-data (1.0.2-14)

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allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti (file dei dati)

DIALIGN-TX è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze proteiche o di DNA. È una completa reimplementazione dell'approccio basato su segmenti che include diverse nuove migliorie e modelli euristici che migliorano significativamente la qualità degli allineamenti in output rispetto a DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Per l'allineamento di coppie, DIALIGN-TX usa un algoritmo di concatenazione dei frammenti che favorisce catene di allineamenti locali a basso punteggio rispetto a frammenti isolati ad alto punteggio. Per gli allineamenti multipli, DIALIGN-TX usa una procedura migliorata che è meno sensibile a somiglianze spurie tra sequenze locali.

Questo pacchetto contiene le matrici dei punteggi e i file di distribuzione delle probabilità di cui DIALIGN-TX ha bisogno per allineare sequenze proteiche e di acidi nucleici.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Made Of: made-of::TODO, role::app-data

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