all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: bio-vcf  ]

Package: bio-vcf (0.9.5-3)

Links for bio-vcf

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package bio-vcf:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

linguaggio specifico per dominio (DSL) per elaborare il formato VCF

Bio-vcf fornisce un linguaggio specifico per dominio (DSL) per elaborare il formato VCF. I campi con i nomi dei record possono essere interrogati con espressioni regolari, es.:

 sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4

Bio-vcf è un parsificatore di nuova generazione per VCF, un filtro e un convertitore. Bio-vcf non solo è molto veloce per dati di interi genomi (WGS), ha anche un linguaggio molto bello per filtrare, valutare e riscrivere e può anche emettere in output qualsiasi tipo di dato testuale, incluse intestazioni VCF e contenuti in RDF e JSON.

Other Packages Related to bio-vcf

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download bio-vcf

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 28.1 kB141.0 kB [list of files]