Paquet source : stacks (2.2+dfsg-1)
Liens pour stacks
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Dépôt de source Debian (Git)
- Suivis des correctifs pour Debian
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Tim Booth (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [creskolab.uoregon.edu]
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- stacks
- pipeline for building loci from short-read DNA sequences
- stacks-web
- web interface for displaying loci from short-read sequences
Autres paquets associés à stacks
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-
- adep: debhelper (>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
-
- adep: python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
-
- adep: zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
-
- adep: libbam-dev
- manipulation d'alignements de séquences de nucléotides au format BAM ou SAM
-
- adep: libsparsehash-dev (>= 2.0)
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
-
- adep: libhts-dev
- development files for the HTSlib
Download stacks
| Fichier | Taille (en ko) | Somme MD5 |
|---|---|---|
| stacks_2.2+dfsg-1.dsc | 2,1 ko | cc7eee26c207be14ac74d7c6eccb01ce |
| stacks_2.2+dfsg.orig.tar.xz | 421,7 ko | ad326c64e6207c5863163fb349e15ec3 |
| stacks_2.2+dfsg-1.debian.tar.xz | 8,9 ko | 717da3e1bf79502192639b3ecc0148ee |
- Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/stacks.git
- Dépôt Debian des paquets source (interface web)
- https://salsa.debian.org/med-team/stacks