Paquet : stacks-web (2.2+dfsg-1)

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Paquets similaires :

web interface for displaying loci from short-read sequences

Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.

This package provides the web-based viewer which you can use to examine Stacks output that has been loaded into a MySQL database.

Autres paquets associés à stacks-web

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: apache2

Serveur HTTP Apache

ou httpd

paquet virtuel fourni par apache2, ebhttpd, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, tntnet, webfs, yaws
dep: default-mysql-server

MySQL database server binaries and system database setup (metapackage)

ou virtual-mysql-server

paquet virtuel fourni par mariadb-server-10.3
dep: libapache2-mod-php

langage de script inclus dans du HTML et exécuté côté serveur (module Apache 2 — version par défaut)
un paquet virtuel est également fourni par libapache2-mod-php7.3

ou php-cgi

server-side, HTML-embedded scripting language (CGI binary) (default)
un paquet virtuel est également fourni par php7.3-cgi
dep: libdbd-mysql-perl

interface Perl5 pour les bases de données MariaDB ou MySQL
dep: php-mdb2-driver-mysql

mysql MDB2 driver

rec: stacks

pipeline for building loci from short-read DNA sequences

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