Paquet : clustalx (2.1+lgpl-9 et autres) [debports]
Liens pour clustalx
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.clustal.org]
Paquets similaires :
alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
Ce paquet offre une interface graphique utilisateur pour le programme Clustal d'alignement de plusieurs séquences. Il fournit un environnement intégré pour effectuer plusieurs alignements par séquence et par profil pour analyser les résultats. L'alignement de séquences est affiché dans une fenêtre sur l'écran. Un système de coloration souple a été intégré pour mettre en évidence les caractéristiques conservées dans l'alignement. Pour les présentations professionnelles, il convient d'utiliser le paquet texshade (LaTeX) ou boxshade .
Les menus déroulants en haut de la fenêtre permettent de sélectionner toutes les options nécessaires pour les traditionnels alignements par séquences multiples et par profil. Vous pouvez couper-coller les séquences pour changer l'ordre de l'alignement ; vous pouvez sélectionner un sous-ensemble de séquences à aligner ; vous pouvez sélectionner une sous-plage de l'alignement à réaligner et réinsérer dans l'alignement original.
Une analyse de la qualité de l'alignement peut être réalisée et les segments à faible score ou les résidus exceptionnels peuvent être mis en évidence.
Autres paquets associés à clustalx
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgl1
- bibliothèque de transport GL indépendante du fournisseur – prise en charge de l’ancienne GL
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- dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0)
- module principal de QT⋅5
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- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0)
- module Qt⋅5 d'interface graphique
- ou libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
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- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)
- module de widgets de Qt⋅5
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- dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2)
- Qt 5 XML module
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- sug: boxshade
- Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
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- sug: clustalw
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages
Télécharger clustalx
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| sparc64 (portage non officiel) | 2.1+lgpl-9+b1 | 356,6 ko | 2 179,0 ko | [liste des fichiers] |