Paquet : r-bioc-oligo (1.70.0+ds-3 et autres)

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Page d'accueil [bioconductor.org]

Paquets similaires :

outils de prétraitement pour des micromatrices d’oligonucléotides

Il s’agit d’un paquet pour analyser des micromatrices d’oligonucléotide (expression/SNP/tiling/exon) au niveau de la sonde. Il prend en charge actuellement Affymetrix (fichiers CEL) et les micromatrices NimbleGen (fichiers XYS).

Autres paquets associés à r-bioc-oligo

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, x32]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, hppa, ia64, loong64, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: r-api-4.0

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4, x32]

Paquet indisponible
dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, sh4, x32]

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

kit de développement logiciel d'analyse de fichiers Affymetrix
dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

outils BioConductor pour l'analyse de fichiers de données d'Affymetrix
dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

fonctions de base pour Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

classes pour des tableaux de grande capacité gérés par oligo et crlmm
dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

collection de fonctions de prétraitement de BioConductor
dep: r-bioc-zlibbioc

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

paquet de GNU R fournissant une interface généraliste de base de données
dep: r-cran-ff

Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data
dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

Database Interface R driver for SQLite
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

sug: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor
sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-biomart

interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
sug: r-bioc-genefilter

méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce
sug: r-bioc-limma

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sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rcolorbrewer

paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées
sug: r-cran-rcurl

GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
sug: r-cran-runit

paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-oligo

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.70.0+ds-3	906,7 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.70.0+ds-3	907,3 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.70.0+ds-3	906,2 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,4 ko	1 348,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	910,9 ko	1 381,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.70.0+ds-3	906,9 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.70.0+ds-3	905,8 ko	1 359,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.70.0+ds-3	910,2 ko	1 421,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.70.0+ds-3	909,3 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.70.0+ds-3	906,7 ko	1 332,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.70.0+ds-3	907,9 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,4 ko	1 354,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.70.0+ds-3	904,3 ko	2 318,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.66.0+ds-1	907,2 ko	1 338,0 ko	[liste des fichiers]