Paquet : r-bioc-oligo (1.70.0+ds-3)

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Il s’agit d’un paquet pour analyser des micromatrices d’oligonucléotide (expression/SNP/tiling/exon) au niveau de la sonde. Il prend en charge actuellement Affymetrix (fichiers CEL) et les micromatrices NimbleGen (fichiers XYS).

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GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

classes pour des tableaux de grande capacité gérés par oligo et crlmm
dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

collection de fonctions de prétraitement de BioConductor
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dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

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dep: r-cran-ff

Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data
dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

Database Interface R driver for SQLite
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

sug: r-bioc-annotationdbi

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sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-biomart

interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
sug: r-bioc-genefilter

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sug: r-cran-knitr

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sug: r-cran-rcolorbrewer

paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées
sug: r-cran-rcurl

GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
sug: r-cran-runit

paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

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Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	907,3 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	906,2 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	909,3 ko	1 356,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	906,7 ko	1 332,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	907,9 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]