Paquet : python3-mdanalysis (2.5.0+dfsg1-2 et autres)

Liens pour python3-mdanalysis

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source mdanalysis :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [www.mdanalysis.org]

Paquets similaires :

analyse molecular dynamics files and trajectories

MDAnalysis is a Python library for the analysis of computer simulations of many-body systems at the molecular scale, spanning use cases from interactions of drugs with proteins to novel materials. It is widely used in the scientific community and is written by scientists for scientists.

MDAnalysis allows one to read particle-based trajectories (including individual coordinate frames such as biomolecules in the PDB format) and access the atomic coordinates through NumPy arrays. This provides a flexible and relatively fast framework for complex analysis tasks. In addition, powerful atom selection commands are implemented. Trajectories can also be manipulated (for instance, fit to a reference structure) and written out.

It works with a wide range of popular simulation packages including Gromacs, Amber, NAMD, CHARMM, DL_Poly, HooMD, LAMMPS and many others — see the lists of supported trajectory formats and topology formats. MDAnalysis also includes widely used analysis algorithms in the MDAnalysis.analysis module.

The MDAnalysis project uses an open governance model and is fiscally sponsored by NumFOCUS.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-mdanalysis

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64]
dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, m68k, ppc64, ppc64el]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 11)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-biopython (>= 1.80)

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-duecredit

Publications (and donations) tracer
dep: python3-fasteners

fourniture de verrous utiles – Python 3.x
dep: python3-griddataformats (>= 0.4.0)

Handling volumetric data in Python
dep: python3-gsd (>= 3.0.1~)

native file format for HOOMD-blue (Python 3 module)
dep: python3-joblib (>= 0.12)

tools to provide lightweight pipelining in Python
dep: python3-matplotlib (>= 1.5.1)

système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3
dep: python3-mmtf (>= 1.0.0)

binary encoding of biological structures (Python 3)
dep: python3-networkx (>= 2.0)

tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
dep: python3-numpy-abi9

paquet virtuel fourni par python3-numpy
dep: python3-packaging

core utilities for python3 packages
dep: python3-scipy (>= 1.5.0)

outils scientifiques pour Python 3
dep: python3-threadpoolctl

Python helpers for common threading libraries (BLAS, OpenMP)
dep: python3-tqdm (>= 4.43.0)

fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

rec: python3-sklearn

Python modules for machine learning and data mining - Python 3

sug: python-mdanalysis-doc

analyse molecular dynamics files and trajectories ( documentation)

Télécharger python3-mdanalysis

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 150,1 ko	20 969,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 072,4 ko	19 723,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.5.0+dfsg1-2+b1	1 991,7 ko	20 055,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.5.0+dfsg1-2+b1	1 949,5 ko	19 075,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.5.0+dfsg1-2+b1	1 914,8 ko	17 637,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 020,9 ko	19 882,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.5.0+dfsg1-2+b1	1 922,4 ko	19 195,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 002,5 ko	20 873,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 119,6 ko	21 516,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 119,5 ko	21 080,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.5.0+dfsg1-2+b2	2 648,4 ko	22 655,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.5.0+dfsg1-2+b1	2 217,4 ko	19 219,0 ko	[liste des fichiers]