Paquet : provean (1.1.5+ds-5 et autres)

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Paquets similaires :

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Autres paquets associés à provean

dépendances

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enhances

dep: cd-hit [non alpha, ia64]

suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non alpha, ia64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha, ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: ncbi-blast+ [non alpha, ia64]

suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

Télécharger provean

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.1.5+ds-2	51,0 ko	161,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.1.5+ds-5	51,1 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.1.5+ds-5	44,8 ko	153,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.1.5+ds-5	45,5 ko	152,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.1.5+ds-5	47,4 ko	152,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	49,7 ko	133,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.1.5+ds-5	52,3 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.1.5+ds-2	61,8 ko	228,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	46,8 ko	153,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	42,1 ko	128,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.1.5+ds-5	49,6 ko	222,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	48,6 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.1.5+ds-5	49,2 ko	153,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.1.5+ds-5	48,1 ko	113,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.1.5+ds-5	50,4 ko	141,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	52,1 ko	152,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	42,3 ko	1 051,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.1.5+ds-5	49,3 ko	136,0 ko	[liste des fichiers]