Paquet : r-bioc-scran (1.30.2+dfsg-1) [debports]
Liens pour r-bioc-scran
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
méthodes de BioConductor pour l’analyse de données de séquençage d’ARN de cellule unique
Implements functions for low-level analyses of single-cell RNA-seq data. Methods are provided for normalization of cell-specific biases, assignment of cell cycle phase, detection of highly variable and significantly correlated genes, identification of marker genes, and other common tasks in routine single-cell analysis workflows.
Autres paquets associés à r-bioc-scran
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: liblapack3
- bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée
- ou liblapack.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.18
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-beachmat
- E/S pour plusieurs formats de stockage de données de matrice
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- dep: r-bioc-biocgenerics
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
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- dep: r-bioc-biocsingular
- décomposition en valeurs singulières pour les paquets de Bioconductor
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- dep: r-bioc-bluster
- Clustering Algorithms for Bioconductor
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- dep: r-bioc-delayedarray
- BioConductor delayed operations on array-like objects
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- dep: r-bioc-delayedmatrixstats
- fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »
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- dep: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
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- dep: r-bioc-limma
- modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)
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- dep: r-bioc-metapod
- méta-analyse avec GNU R de valeurs-p d’analyses différentielles
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- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-scuttle
- BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities
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- dep: r-bioc-singlecellexperiment
- S4 Classes for Single Cell Data
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor assay container
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- dep: r-cran-bh
- paquet (virtuel) de GNU R pour fournir BH
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- dep: r-cran-dqrng
- GNU R fast pseudo random number generators
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- dep: r-cran-igraph
- analyse et visualisation de réseau avec GNU R
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- dep: r-cran-matrix
- paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
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- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
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- dep: r-cran-statmod
- GNU R package providing algorithms and functions for statistical modeling
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- sug: r-bioc-biobase
- fonctions de base pour Bioconductor
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-deseq2
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
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- sug: r-bioc-hdf5array
- HDF5 backend for DelayedArray objects
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- sug: r-bioc-monocle
- clustering, differential expression, and trajectory analysis for RNA-Seq
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- sug: r-bioc-residualmatrix
- Creating a DelayedMatrix of Regression Residuals
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- creating a DelayedMatrix of scaled and centered values using GNU R
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- sug: r-bioc-scater
- Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R
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- Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
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- méthodes pour la détection de regroupements pour le regroupement hiérarchique
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- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-pheatmap
- GNU R package to create pretty heatmaps
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- convert R markdown documents into a variety of formats
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- sug: r-cran-testthat
- GNU R testsuite
Télécharger r-bioc-scran
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| hppa (portage non officiel) | 968,1 ko | 1 429,0 ko | [liste des fichiers] |