Paquet : blixem (4.44.1+dfsg-7.1 et autres)

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Paquets similaires :

navigateur interactif d’alignements de séquences

Blixem est un navigateur interactif d’alignements de séquences qui ont été empilés dans un alignement multiple de type « maître-esclave » ; il ne s’agit pas d’un vrai alignement multiple mais d’un alignement « un vers beaucoup ».

 * section aperçu montrant les emplacements des gènes et des alignements
   autour de la fenêtre d’alignement ;
 * section détail montrant l’alignement de séquences de protéines ou de
   nucléotides dans la séquence d’ADN génomique ;
 * voir des alignements entre les deux brins de la séquence de référence ;
 * voir des séquences en mode nucléotide ou protéine ; en mode protéine,
   Blixem affiche la traduction en trois cadres de la séquence de
   référence ;
 * les résidus sont surlignés en différentes couleurs en fonction de s’il
   s’agit d’une correspondance parfaite, d’une substitution conservée ou
   d’une non-correspondance ;
 * les alignements avec trous sont pris en charge, les insertions ou
   suppressions étant surlignées dans la séquence correspondante ;
 * les correspondances peuvent être triées et filtrées ;
 * les polymorphismes de nucléotides simples (SNP) et autres variations
   peuvent être surlignés dans la séquence de référence ;
 * les queues Poly(A) peuvent être affichées et les signaux poly(A) peuvent
   être surlignés dans la séquence de référence.

Étiquettes: Boîte à outils d'interface utilisateur: GTK

Autres paquets associés à blixem

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec OpenSSL
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [non ia64]

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec OpenSSL
dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

bibliothèque GLib de routines C

dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [non ia64]
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

bibliothèque d'interface graphique utilisateur GTK –⋅version ancienne
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

Mise en place et rendu de texte internationalisé
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

Bibliothèque partagée SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

Télécharger blixem

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 327,7 ko	2 430,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 348,6 ko	2 220,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 312,6 ko	2 292,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 292,3 ko	2 160,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 298,2 ko	1 904,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 329,3 ko	2 182,0 ko	[liste des fichiers]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 360,9 ko	2 356,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1	1 378,9 ko	3 243,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 325,5 ko	2 290,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 336,6 ko	2 246,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 350,4 ko	2 634,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 346,4 ko	2 676,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 348,3 ko	2 548,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 335,7 ko	2 016,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 322,5 ko	2 270,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 359,4 ko	2 228,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 294,2 ko	3 224,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 347,9 ko	2 164,0 ko	[liste des fichiers]