Paket: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 und andere)

Links für blixem

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket seqtools herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [www.sanger.ac.uk]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Markierungen: GUI-Baukasten: GTK

Andere Pakete mit Bezug zu blixem

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nicht ia64]

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)
dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

GLib - Bibliothek von C-Routinen

dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [nicht ia64]
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

GTK - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen - alte Version
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

blixem herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.327,7 kB	2.430,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.348,6 kB	2.220,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.312,6 kB	2.292,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.292,3 kB	2.160,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.298,2 kB	1.904,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.329,3 kB	2.182,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.360,9 kB	2.356,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1	1.378,9 kB	3.243,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.325,5 kB	2.290,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.336,6 kB	2.246,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.350,4 kB	2.634,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.346,4 kB	2.676,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.348,3 kB	2.548,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.335,7 kB	2.016,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1.322,5 kB	2.270,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.359,4 kB	2.228,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.294,2 kB	3.224,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1.347,9 kB	2.164,0 kB	[Liste der Dateien]