Paquet : ariba (2.14.7+ds-7 et autres)
Liens pour ariba
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source ariba :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Sascha Steinbiss (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
identification de résistance antibiotique par assemblage
ARIBA est un outil identifiant les gènes de résistance antibiotique en lançant des assemblages locaux. L'entrée est un fichier FASTA de gènes de référence et de lectures de séquençages appairés. ARIBA rapporte les gènes de référence trouvés ainsi que des informations supplémentaires sur la qualité des assemblages et de toutes les variantes entre les lectures de séquençage et les gènes de référence.
Autres paquets associés à ariba
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- dep: bowtie2 [non m68k]
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
- dep: bowtie2 (>= 2.1.0) [m68k]
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- dep: cd-hit
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- dep: fastaq [non m68k]
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
- dep: fastaq (>= 3.12.0) [m68k]
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
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- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
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- dep: libfml0 (>= 0.1) [non m68k]
- library for assembling Illumina short reads in small regions
- dep: libfml0 (>= 0.1-4~) [m68k]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libminimap0 (>= 0.2)
- library for approximate mapping of long biosequences
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non m68k]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k]
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- dep: mash
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- dep: mummer
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- dep: python3
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- dep: python3 (<< 3.11) [m68k]
- dep: python3 (<< 3.13) [alpha]
- dep: python3 (<< 3.14) [non alpha, m68k]
- dep: python3 (>= 3.12~) [alpha]
- dep: python3 (>= 3.13~) [non alpha, m68k]
- dep: python3 (>= 3.9~) [m68k]
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- dep: python3-biopython
- bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
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- dep: python3-bs4 (>= 4.1.0) [non m68k]
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- Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
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- Bibliothèque de compression - binaires
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- sug: spades
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
Télécharger ariba
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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alpha (portage non officiel) | 2.14.7+ds-4 | 1 908,0 ko | 20 531,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 911,2 ko | 20 464,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 906,5 ko | 20 532,0 ko | [liste des fichiers] |
loong64 (portage non officiel) | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 908,5 ko | 20 532,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 2.14.6+ds-2+b1 | 1 910,0 ko | 20 567,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 909,7 ko | 20 536,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 910,8 ko | 20 532,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 2.14.7+ds-7+b1 | 1 909,2 ko | 20 428,0 ko | [liste des fichiers] |