Paquet : freebayes (1.3.7-1~exp et autres)

Liens pour freebayes

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source freebayes :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

détection bayésienne de polymorphismes basée sur les haplotypes et génotypage

FreeBayes est un détecteur de variant génétique bayésien conçu pour détecter des petits polymorphismes, plus spécialement les polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP), les indels (insertions et suppressions), les polymorphismes de nucléotides multiples (MNP) et les évènements complexes (évènements d’insertion et de substitution composites), plus petits que la longueur d’un alignement de séquençage de lecture courte.

Autres paquets associés à freebayes

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [non ia64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [non amd64]
dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [non amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]
dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

Télécharger freebayes

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1 453,0 ko	4 027,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1 397,1 ko	3 922,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.3.7-1~exp	1 378,4 ko	3 821,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.3.7-1~exp	1 386,2 ko	3 445,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.3.7-1~exp	1 502,3 ko	4 185,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.3.7-1~exp+b1	1 573,9 ko	5 599,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.3.7-1~exp+b1	1 404,1 ko	3 930,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1 428,4 ko	4 378,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.3.7-1~exp+b1	1 455,3 ko	4 498,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1 473,5 ko	4 307,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64 (portage non officiel)	1.3.7-1~exp	1 435,6 ko	3 701,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.3.7-1~exp	1 375,9 ko	4 052,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.3.7-1~exp+b1	1 533,1 ko	3 916,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.3.7-1~exp	1 357,1 ko	4 639,0 ko	[liste des fichiers]