Paket: freebayes (1.3.7-1~exp und andere)

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Homepage [github.com]

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Andere Pakete mit Bezug zu freebayes

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34) [nicht ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nicht amd64]
dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [nicht amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]
dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

freebayes herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1.453,0 kB	4.027,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1.397,1 kB	3.922,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.3.7-1~exp	1.378,4 kB	3.821,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.3.7-1~exp	1.386,2 kB	3.445,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.3.7-1~exp	1.502,3 kB	4.185,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp+b1	1.573,9 kB	5.599,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp+b1	1.404,1 kB	3.930,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1.428,4 kB	4.378,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp+b1	1.455,3 kB	4.498,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1.473,5 kB	4.307,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64 (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp	1.435,6 kB	3.701,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.3.7-1~exp	1.375,9 kB	4.052,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp+b1	1.533,1 kB	3.916,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1~exp	1.357,1 kB	4.639,0 kB	[Liste der Dateien]