[ Paquet source : pbsuite ]
Paquet : pbhoney (15.8.24+dfsg-3)
Liens pour pbhoney
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source pbsuite :
- [pbsuite_15.8.24+dfsg-3.dsc]
- [pbsuite_15.8.24+dfsg.orig.tar.xz]
- [pbsuite_15.8.24+dfsg-3.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [sourceforge.net]
Paquets similaires :
genomic structural variation discovery
PBHoney is an implementation of two variant-identification approaches designed to exploit the high mappability of long reads (i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read discordance and soft-clipped tails of long reads to identify structural variants.
PBHoney is part of the PBSuite.
Autres paquets associés à pbhoney
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- dep: blasr (>= 5.3)
- correspondance de lectures de séquençage de molécules simples
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- dep: python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
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- dep: python-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)
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- dep: python-intervaltree-bio
- Interval tree convenience classes for genomic data -- Python 2 library
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- dep: python-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks
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- dep: python-numpy
- gestion rapide des tableaux avec Python
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- dep: python-pbbanana (= 15.8.24+dfsg-3)
- additional utilities for the pbsuite
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- dep: python-pbsuite-utils (= 15.8.24+dfsg-3)
- software for Pacific Biosciences sequencing data -- Python utilities
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- dep: python-pysam (>= 0.8.0)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
-
- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- rec: pbdagcon
- sequence consensus using directed acyclic graphs
Télécharger pbhoney
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 1 280,3 ko | 2 356,0 ko | [liste des fichiers] |