[ Paquet source : r-bioc-genomicalignments ]
Paquet : r-bioc-genomicalignments (1.26.0-1)
Liens pour r-bioc-genomicalignments
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-genomicalignments :
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0-1.dsc]
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-genomicalignments_1.26.0-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
This BioConductor package provides efficient containers for storing and manipulating short genomic alignments (typically obtained by aligning short reads to a reference genome). This includes read counting, computing the coverage, junction detection, and working with the nucleotide content of the alignments.
Autres paquets associés à r-bioc-genomicalignments
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.55.7)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.13.1)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.13)
- BioConductor assay container
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- rec: r-bioc-shortread (>= 1.24.0)
- GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
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- rec: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- sug: r-bioc-deseq2
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
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- sug: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
Télécharger r-bioc-genomicalignments
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| mips64el | 2 140,7 ko | 2 993,0 ko | [liste des fichiers] |