[ Source: covtobed ]
Paketti: covtobed (1.3.5+dfsg-2)
Links for covtobed
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti covtobed:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
convert the coverage track from a BAM file into a BED file
Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.
Muut pakettiin covtobed liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: bamtools
- toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi covtobed
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 49.8 kt | 146.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 44.6 kt | 146.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 42.8 kt | 125.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 44.6 kt | 97.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 53.4 kt | 149.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 46.4 kt | 215.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 49.7 kt | 210.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 46.3 kt | 138.0 kt | [tiedostoluettelo] |