Paketti: covtobed (1.3.5+dfsg-2 ja muut)

Links for covtobed

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti covtobed:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Muut pakettiin covtobed liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bamtools

toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armhf]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: zlib1g

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi covtobed

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.3.5+dfsg-2	49.8 kt	146.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45.0 kt	147.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44.6 kt	97.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.3.5+dfsg-2	53.4 kt	149.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49.7 kt	210.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48.2 kt	111.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46.3 kt	138.0 kt	[tiedostoluettelo]