Paketti: tabix (1.20+ds-1 ja muut)

Links for tabix

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti htslib:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Tagit: Implemented in: C, Role: Program, Tiede: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Muut pakettiin tabix liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi tabix

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	478.0 kt	2,700.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.20+ds-1	471.4 kt	2,249.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.20+ds-1	438.8 kt	2,249.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.20+ds-1	401.4 kt	2,062.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.20+ds-1	404.8 kt	1,494.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	461.7 kt	2,282.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.20+ds-1	517.3 kt	2,566.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.19+ds-1.1+b1	558.6 kt	4,599.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	435.0 kt	2,078.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.20+ds-1	430.6 kt	2,618.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	494.7 kt	3,145.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.20+ds-1	508.1 kt	3,017.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.20+ds-1	488.8 kt	1,893.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.20+ds-1	462.5 kt	2,465.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	493.9 kt	1,993.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	402.4 kt	3,160.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.20+ds-1	473.0 kt	2,198.0 kt	[tiedostoluettelo]