Paket: r-bioc-tfbstools (1.44.0+dfsg-2 und andere)
Links für r-bioc-tfbstools
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket r-bioc-tfbstools herunterladen:
- [r-bioc-tfbstools_1.44.0+dfsg-2.dsc]
- [r-bioc-tfbstools_1.44.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-tfbstools_1.44.0+dfsg-2.debian.tar.xz]
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [bioconductor.org]
Ähnliche Pakete:
GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis
TFBSTools is a package for the analysis and manipulation of transcription factor binding sites. It includes matrices conversion between Position Frequency Matirx (PFM), Position Weight Matirx (PWM) and Information Content Matrix (ICM). It can also scan putative TFBS from sequence/alignment, query JASPAR database and provides a wrapper of de novo motif discovery software.
Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-tfbstools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: r-api-3.5 [sh4, sparc64]
- Paket nicht verfügbar
-
- dep: r-api-4.0 [nicht sh4, sparc64]
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16 [x32]
- Paket nicht verfügbar
-
- dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64]
- Paket nicht verfügbar
-
- dep: r-api-bioc-3.20 [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-api-bioc-3.8 [sh4, sparc64]
- Paket nicht verfügbar
-
- dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sh4, sparc64]
- GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
-
- dep: r-bioc-biobase (>= 2.28)
- base functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.14.0)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.2.21)
- BioConductor facilities for parallel evaluation
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.36.4)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.36.3)
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
-
- dep: r-bioc-cner (>= 1.4.0)
- CNE Detection and Visualization
-
- dep: r-bioc-dirichletmultinomial (>= 1.10.0)
- Dirichlet-Multinomial Mixture Model Machine Learning for Microbiome Data
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.6.1)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.20.6)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.2.7)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-pwalign [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]
- Perform pairwise sequence alignments
-
- dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.28.10)
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-seqlogo (>= 1.34.0)
- GNU R sequence logos for DNA sequence alignments
-
- dep: r-bioc-xvector (>= 0.8.0)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- dep: r-cran-catools (>= 1.17.1)
- GNU R package providing various utility functions
-
- dep: r-cran-dbi (>= 0.6)
- GNU-R-Paket, stellt eine allgemeine Datenbankschnittstelle bereit
-
- dep: r-cran-gtools (>= 3.5.0)
- GNU R package with R programming tools by Greg Warnes et al
-
- dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)
- R-Datenbank-Schnittstellentreiber für SQLite
-
- dep: r-cran-tfmpvalue (>= 0.0.5)
- GNU R P-Value Computation for Position Weight Matrices
-
- dep: r-cran-xml (>= 3.98-1.3)
- GNU R package for XML parsing and generation
-
- sug: r-bioc-biocstyle (>= 1.7.7) [nicht sh4, sparc64]
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-cran-knitr (>= 1.11)
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
-
- sug: r-cran-rmarkdown [nicht sh4, sparc64]
- Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate
-
- sug: r-cran-testthat
- GNU R testsuite
r-bioc-tfbstools herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
alpha (inoffizielle Portierung) | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,3 kB | 1.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,3 kB | 1.865,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,2 kB | 1.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 1.40.0+dfsg-1 | 979,8 kB | 1.836,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.40.0+dfsg-1 | 980,6 kB | 1.841,0 kB | [Liste der Dateien] |
loong64 (inoffizielle Portierung) | 1.44.0+dfsg-2 | 999,9 kB | 1.912,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,2 kB | 1.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,9 kB | 1.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,7 kB | 1.913,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,1 kB | 1.857,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 1.44.0+dfsg-2 | 1.000,7 kB | 1.861,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.20.0+dfsg-1 | 874,6 kB | 1.736,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.20.0+dfsg-1 | 874,2 kB | 1.737,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 1.36.0+dfsg-2 | 987,8 kB | 1.852,0 kB | [Liste der Dateien] |