Paket: prime-phylo (1.0.11-10 und andere) [debports]
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- Homepage [prime.sbc.su.se]
Ähnliche Pakete:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Andere Pakete mit Bezug zu prime-phylo
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- dep: libblas3
- Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek
- oder libblas.so.3
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
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- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- Serialisierungsbibliothek für C++
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- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: liblapack3
- Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version
- oder liblapack.so.3
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.6)
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-9)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- GNOME-XML-Bibliothek
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
-
- sug: mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
-
- sug: mrbayes
- Bayessche Inferenz der Phylogenie
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
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- sug: njplot
- Programm zur Darstellung phylogenetischer Bäume
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik
-
- sug: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
-
- sug: treeviewx
- Anzeige und Druck phylogenetischer Bäume
prime-phylo herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 1.0.11-10+b1 | 751,7 kB | 3.724,0 kB | [Liste der Dateien] |