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Paket: mrbayes (3.2.6+dfsg-1 und andere) [debports]

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Die Bayessche Inferenz der Phylogenie basiert auf einer Quantität - A-posteriori-Wahrscheinlichkeitsverteilung von Bäumen genannt - die die Wahrscheinlichkeit eines Baumes bedingt durch die Beobachtungen ist. Die Bedingung entsteht durch Verwendung des Bayestheorems. Die A-posteriori-Wahrscheinlichkeitsverteilung von Bäumen kann unmöglich analytisch berechnet werden. Stattdessen verwendet MrBayes eine Simulation, das Markov-Chain-Monte-Carlo-Verfahren (kurz MCMC), um die A-posteriori-Wahrscheinlichkeiten der Bäume zu schätzen.

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